La relazione di riferimento è un obbligo al quale sono potenzialmente soggetti gli impianti rientranti nella normativa IPPC. E' una relazione che contiene informazioni sullo stato di qualità del suolo e delle acque sotterranee, con riferimento alla presenza di sostanze pericolose pertinenti, necessarie al fine di effettuare un raffronto in termini quantitativi con lo stato al momento della cessazione definitiva delle attività. La Lombardia ha fornito indicazioni sulle tempistiche di presentazione della verifica di applicabilità della relazione di riferimento, e sulle tempistiche della eventuale relazione di riferimento. La circolare regionale ribadisce che la valutazione di applicabilità della relazione di riferimento, e nel caso la relazione stessa, devono essere presentate secondo la tempistica fissata nell'autorizzazione integrata ambientale; se l'AIA non fissa una tempistica, l'ente ha definito in dettaglio le tempistiche da applicare secondo quattro diverse casistiche.